NetCDF4/インストール（aptを使う場合）

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NetCDF4-Cはapt installを使ってインストールできるので，その時のメモです．

ほぼこのページに従えばOKです．

各種ライブラリのインストール

ここで，HDF5とNetCDF-Cなどのライブラリもaptで入れてしまいます．

sudo apt update
sudo apt install hdf5-tools hdf5-helpers libhdf5-dev libhdf5-doc libhdf5-serial-dev
sudo apt install libnetcdf-dev

NetCDF-Fortranのインストール

NetCDF-Fortranはソースからビルドが必要です．ここからソースをDLしましょう．

homeディレクトリにいることを想定してコマンドを実行しています．

mkdir downloads
cd downloads
wget https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf-fortran/4.6.0/netcdf-fortran-4.6.0.tar.gz
tar xzf netcdf-fortran-4.6.0.tar.gz
cd netcdf-fortran-4.6.0/

netcdf-fortran-x.x.xのディレクトリに移動したら，configure用のスクリプト(config-intel.sh)を作成します．

export CDFROOT="/usr"
export LD_LIBRARY_PATH="${CDFROOT}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}"
export LDFLAGS="-L${CDFROOT}/lib -I${CDFROOT}/include":
export OPTIM="-O3 -mcmodel=large -fPIC ${LDFLAGS}"
#
export CC=icc
export CXX=icpc
export FC=ifort
export F77=ifort
export F90=ifort
export CPP='icc -E -mcmodel=large'
export CXXCPP='icpc -E -mcmodel=large'
export CPPFLAGS="-DNDEBUG -DpgiFortran ${LDFLAGS}"
#
export CFLAGS=" ${OPTIM}"
export CXXFLAGS=" ${OPTIM}"
export FCFLAGS=" ${OPTIM}"
export F77FLAGS=" ${OPTIM}"
export F90FLAGS=" ${OPTIM}"
#
./configure --prefix=/usr/local/netcdf-ifort/4.6.0 --enable-large-file-tests --with-pic # 4.6.0の部分だけ自分のversionに合わせて変更

あとは，config-intel.shを実行したのちに，makeをします．

chmod 755 config-intel.sh
./config-intel.sh
make
make check
sudo make install

インストールが終わったら，忘れずにPATH追加

homeディレクトリにある.bashrcに以下を追記します．

export PATH="/usr/local/netcdf-ifort/4.5.2/bin:$PATH"
export LD_LIBRARY_PATH="/usr/local/netcdf-ifort/4.5.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH"

インストールができているかをチェックします．

nf-config --all

↑を実行して，以下が出ればOK

This netCDF-Fortran 4.6.0 has been built with the following features:

  --cc        -> icc
  --cflags    -> -I/usr/local/netcdf-ifort/4.6.0/include -DNDEBUG -DpgiFortran -L/usr/lib -I/usr/include:

  --fc        -> ifort
  --fflags    -> -I/usr/local/netcdf-ifort/4.6.0/include -I/usr/local/netcdf-ifort/4.6.0/include
  --flibs     -> -L/usr/local/netcdf-ifort/4.6.0/lib -lnetcdff -L/usr/lib -I/usr/include: -lnetcdf -lnetcdf -lm
  --has-f90   ->
  --has-f03   -> yes

  --has-nc2   -> yes
  --has-nc4   -> yes

  --prefix    -> /usr/local/netcdf-ifort/4.6.0
  --includedir-> /usr/local/netcdf-ifort/4.6.0/include
  --version   -> netCDF-Fortran 4.6.0

参考